Sagen wir mal so: Wenn Du vesuchst, im Windows-Explorer ein komplettes Dateisystem mit mehreren 100tsd Dateien zu kopieren fliegt dir die GUI auch um die Ohren. Da nimmt man auch Konsolentools, wenn man will, das es klappt - z.B. robocopy.

Poste doch mal ein
Code:
fdisk -l
- dann sieht man evtl, woran es hakt.